Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms