Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNGA1P29973 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms