Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB4P28070 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms