Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms