Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5F1P24539 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5F1P24539 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms