Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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