Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA2P01563 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms