Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNSO60931 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNSO60931 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNSO60931 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms