Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM2O43147 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM2O43147 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM2O43147 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms