Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F3O00716 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F3O00716 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F3O00716 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F3O00716 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F3O00716 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F3O00716 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F3O00716 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms