Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHL1O00533 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHL1O00533 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHL1O00533 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHL1O00533 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHL1O00533 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms