Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms