Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJE1A6NN92 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms