Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms