Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms