Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms