Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms