Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms