Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms