Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNIKQ9UKE5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNIKQ9UKE5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms