Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI30

TRMT112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT112Q9UI30 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT112Q9UI30 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT112Q9UI30 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms