Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DKK2Q9UBU2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms