Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms