Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms