Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM53CQ9NYF3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms