Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms