Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGR6Q9HBX8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms