Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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COMMD5Q9GZQ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COMMD5Q9GZQ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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