Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms