Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms