Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms