Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYCP2Q9BX26 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms