Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms