Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms