Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHOX2BQ99453 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms