Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM20AQ96MK3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM20AQ96MK3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM20AQ96MK3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM20AQ96MK3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM20AQ96MK3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM20AQ96MK3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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