Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms