Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PKNOX2Q96KN3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms