Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms