Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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DTX3Q8N9I9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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