Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU1Q7Z7A3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTU1Q7Z7A3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU1Q7Z7A3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU1Q7Z7A3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTU1Q7Z7A3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTU1Q7Z7A3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms