Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECW1Q76N89 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HECW1Q76N89 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms