Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms