Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms