Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZCCHC12Q6PEW1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms