Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD2Q6P5Q4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMOD2Q6P5Q4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms