Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms