Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FHOD3Q2V2M9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FHOD3Q2V2M9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms