Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.6 ms