Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CRY1Q16526 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRY1Q16526 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CRY1Q16526 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRY1Q16526 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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